准格尔旗远离海洋，大陆性气候突出，属典型的半干旱地区。受季风影响，冬季多西北风，漫长而寒冷，夏季受偏南暖湿气流影响，短暂、炎热、雨水集中，春季风多、少雨，多干旱，秋季凉爽。由于地处中温带又在鄂尔多斯高原东测斜坡上，拔海高度相对偏低，故气温偏暖，四季分明，无霜期较长，日照充足，相对湿度为52%,。

　　由于地形构造比较复杂,因此全旗平均气温时空分布上有一定差异，基本分布呈东南高，北部次之，中部和西部略低。全旗年平均气温在6.2℃～8.7℃之间，极端最低温度为-32.8℃，极端最高温度为40.4℃。累年夏季平均日较差12.2℃，冬季平均日较差14.4℃。全旗平均降水量在379～420毫米之间，降水趋势自东南向西北递减。全年降水重要集中在4～9月，其中7、8月是雨水最集中期，平均雨量达到103毫米，夏季的6到8月降水量占年总降水量的64%，有利于农作物的生长。年最大降水量为636.5毫米，出现在1965年，年最小降水量为142.5毫米，出现在1961年（图3.4）。

　　风力分布不均，趋势是北部较大，南部较小，中部次之。

　　影响农牧业生产的主要气象灾害有：干旱、冰雹、霜冻、暴雨和山洪、大风等。